Désignation d'une branche de la biologie moléculaire visant à étudier la structure du génome (ensemble du matériel génétique dans un organisme) et la fonction ainsi que l'interaction des gènes (des facteurs héréditaires localisés sur le brin d'ADN dans les chromosomes de chaque noyau cellulaire). Ingénierie génétique ou Génie génétique est l'application de méthodes génétiques à la pratique et signifie le plus souvent la manipulation artificielle de gènes dans le but d'introduire dans un organisme existant des propriétés souhaitées qui n'existaient pas jusqu'à présent, comme la résistance aux maladies fongiques, par l'implantation techniquement réalisable de gènes étrangers isolés reproduits à partir d'organismes étrangers à l'espèce dans le génome d'une variété ou d'une race.
Réaction en chaîne par polymérase
Depuis l'invention, dans les années 1990, de la méthode PCR (Polymerase Chain Reaction) pour la reproduction de très petites quantités d'ADN, il est désormais possible de caractériser, de définir et de reconnaître clairement les cépages en tant que variétés sur le plan génotypique, à l'aide de méthodes de caractérisation génétique moléculaire. Le génotype a ainsi été introduit dans l'ampélographie et peut contribuer à clarifier de nombreuses questions encore en suspens, en complément de l'ampélographie traditionnelle, basée visuellement sur le phénotype. Chaque variété de vigne autonome, germée à partir d'une graine, est représentée par un génotype unique, caractérisé par la recombinaison unique des caractères héréditaires maternels et paternels pendant la fécondation et présent dans le noyau de chaque cellule végétale. Chaque cépage issu de la reproduction sexuée présente un modèle génétique individuel qui le distingue de tous les autres cépages.
Analyse des microsatellites
Pour les comparaisons génotypiques ou l'identification des cépages et la détermination du couple parental, on utilise ce que l'on appelle l'empreinte génétique, qui peut être établie par une analyse des microsatellites. Les microsatellites sont des zones repérables de la longue chaîne d'ADN, définies par des marqueurs moléculaires, qui présentent un nombre différent de séquences de bases répétées. Ces séquences, qui se répètent deux fois pour le double jeu de chromosomes de la vigne (2 x 19 = 38), peuvent être de longueur différente entre deux chromosomes homologues ou d'un cépage à l'autre. On peut copier et reproduire ces séquences sous forme de fragments individuels, ce qui permet d'obtenir une caractéristique déterminée par la longueur de ces fragments de génome.
empreinte génétique
De nombreux fragments de ce type, toujours présents par paires et provenant de plusieurs lieux génétiques, donnent un modèle de fragments typique et caractéristique de ce cépage, qui peut être comparé avec les modèles de fragments d'autres cépages. Ce modèle de fragments est en quelque sorte une empreinte génétique (fingerprint). La probabilité que deux cépages présentent le même modèle est statistiquement d'environ 1 sur 6 millions, ce qui, avec seulement 14.000 cépages et souches existants, est une probabilité infime. Au sein des instituts européens de sélection de la vigne, on s'accorde à dire que pour la caractérisation génotypique des cépages, il suffit de déterminer le génotype sur six sites génétiques définis (microsatellites) pour définir clairement le profil d'un cépage.
Identification visuelle au moyen du phénotype
Avant la méthode d'analyse des microsatellites, la comparaison et la délimitation des variétés n'étaient possibles que par la morphologie comparative (forme extérieure) du cep de vigne. On décrivait les caractéristiques typiques de la...
